近幾年，商品有機肥的被關注度越來越高，這是因為一方面商品有機肥的制作工藝越來越先進，肥料的功效大大提高；另一方面使用有機肥以后改善了土壤的理化狀況，提高了各類養分的吸收利用率。
在蔬菜種植中堅持使用商品有機肥更能有效維護土壤的健康狀態，而在新棚或多年的老棚土壤改良方面，商品有機肥更有優勢。
首先，商品有機肥比糞肥“無害”。
兩種肥料的區別重點在于“腐熟”和“無害”。與商品有機肥相比，糞肥存在許多缺陷：
一是含鹽分較多，容易使土壤鹽化。
二是糞肥帶有大量的病菌、蟲卵，引發棚室內的病蟲草害；
三是糞肥養分含量不穩定，不能做到合理補肥。
四是糞肥內若含有害物質、重金屬物質時，僅憑借高溫發酵不能去除。
商品有機肥：
一是富含有益微生物菌群，環境適應性強，易發揮出種群優勢。
二是富含生理活性物質，如吲哚乙酸、赤霉素、多種維生素以及氨基酸、核酸、生長素等。
商品有機肥不同于糞肥使用方法應有變
雖然說商品有機肥與糞肥同樣能夠改良土壤，但使用方法是不一樣的。記者在采訪時了解到，有些菜農使用商品有機肥后感覺不如糞肥有效果，這是因為使用的方法沒有改變造成的。
